WWW.ДЕНЬСИЛЫ.РФ

БЕСПЛАТНАЯ ЭЛЕКТРОННАЯ БИБЛИОТЕКА - Медицина

 

Pages:     | 1 |   ...   | 3 | 4 || 6 | 7 |   ...   | 8 |

Эпидемиология и молекулярно-генетические основы наследственных заболеваний нервной системы в республике башкортостан

-- [ Страница 5 ] --

В состав гена HD входит ряд полиморфных участков, сцепленных с (CAG)n-повторами. К таким участкам относятся (CCG)n-повторы, почти непосредственно прилежащие к (СAG)n-тракту в первом экзоне гена. В экзоне 58 на расстоянии 150 т.п.н. от полиморфного (СAG)n-участка в ряде случаев обнаруживается нейтральная делеция одного из четырех GAG-кодонов, кодирующих пролин, - del2642. Исследование распределения частот аллелей локуса, содержащего (CAG)n-повторы, и сцепленных с ним других полиморфных маркеров, в различных популяциях может способствовать выяснению условий возникновения, распространения и сохранения мутантных аллелей и, в целом, способствовать оценке риска развития патологии на популяционном уровне.

С целью определения закономерностей экспансии (СAG)n-повторов в гене HD и происхождения ее у больных хореей Гентингтона в РБ, мы проанализировали полиморфизм (СAG)n-, (CCG)n-повторов и делеции del2642 гена HD в 11 популяциях Волго-Уральского региона, а также в 46 семьях с ХГ из Башкортостана, включающих 59 больных и 127 их близких родственников.

В популяциях Волго-Уральского региона было выявлено 26 аллельных вариантов СAG - локуса с числом триплетов от 9 до 36 (рис.3). Распределение частот аллелей соответствует нормальному одномодальному, с пиком в (CAG)17, что согласуется с данными других исследователей [Rubinsztein D. et al., 1994; Kremer B. et al., 1994; Watkins W. et al., 1995].

Рисунок 3. Распределение частот аллелей локуса (CAG)n повторов гена HD в популяциях Волго-Уральского региона. По оси абсцисс – число (CAG)n повторов, по оси ординат – частоты аллелей.

“Переходные” аллели, содержащие более 29 триплетов CAG, составляющие резерв для развития из них мутации, с частотой <1% обнаружены в популяциях русских, чувашей, мордвы и удмуртов. Среди башкир, татар, марийцев и коми не найдены аллели (CAG)29-35. Проведенный нами анализ распространенности хореи Гентингтона в Башкортостане показал, что наименьший ее показатель имеют башкиры - 0.89 на 100000 жителей, в то время как среди русских и татар степень распространенности достигает 4.02 и 5.14 на 100000 жителей, соответственно. Однако в популяции башкир Илишевского района у человека 65 лет без клинических проявлений хореи Гентингтона, и в семье которого не было случаев ХГ, обнаружен аллель с 36 CAG-повторами, т.е. экспансия триплетного повтора, что встречается исключительно редко. Возраст проявления заболевания у таких пациентов приходится, как правило, на 6-7 декаду жизни. Следует отметить, что по данным Медико-генетического центра г. Уфы, за 26 лет не было ни одного случая хореи в Илишевском районе Башкортостана. Таким образом, обнаруженная нами экспансия повтора – это, фактически, новый случай хореи.

По характеру распределения частот аллелей локуса (CAG)n-повторов в гене HD наблюдается значительная популяционная неоднородность. По этим показателям популяции Волго-Уральского региона в большей степени сопоставимы с популяциями Европы.

В локусе (CCG)n-повторов обнаружено 6 вариантов аллелей, содержащих от 6 до 12 триплетов, за исключением аллеля (CCG)11. Во всех популяциях самыми частыми являются аллель (CCG)7, встречающийся в среднем с частотой 0.603, и (CCG)10– его частота составляет в среднем 0.333.

В результате регрессионного анализа сцепления полиморфных участков (CAG)n и (CCG)n, для популяций Волго-Уральского региона в целом установлена обратная нелинейная зависимость между числом повторов в этих участках на одной хромосоме. Аллели с семью CCG-повторами сцеплены с аллелями, содержащими в среднем 19.2 ± 3.8 CAG-повторов, а (CCG)10 - с аллелями, содержащими 17.3 ± 1.5 CAG-повторов (табл. 5).

Таблица 5. Среднее число (CAG)n повторов на хромосомах с различными вариантами аллелей (CCG)n и del2642 в популяциях Волго-Уральского региона

Аллели (CCG)7 (CCG)10 del del+
Число (CAG)n повторов 19.20±3.8 17.30±1.5 17.92±3.00 19.75±5.26
Число хромосом 1204 182
Достовер-ность различий Сравне-ние средних1 U=109678.50, Z=7.05, p<<0.00001 U=661.00, Z= –2.04, p=0.0418
ANOVA F=18.606, р<<0.001 2 H=4.42, р=0.0355 3


Примечания: 1непараметрический ранговый критерий Манна-Уитни, 2однофакторный дисперсионный анализ (ANOVA) для аллелей (CCG)6, (CCG)7, (CCG)8, (CCG)9, (CCG)10 и (CCG)12, 3ранговый непараметрический ANOVA Крускала-Уоллеса, так как в выборке не соблюдалась нормальность распределения согласно тесту Шапиро-Уилка.

При исследовании нейтральной полиморфной делеции del2642 гена HD в популяциях Волго-Уральского региона установлена ее достоверная ассоциация с аллелями (CAG)n локуса, содержащими в среднем 19.75±5.26 CAG -повторов, а отсутствие делеции (del–) – с аллелями, содержащими 17.92±3.0 CAG –повторов (см. табл. 5). Эти данные подтверждают предположение о возникновении данной делеции преимущественно на хромосомах с числом CAG повторов 20 [Almqvist E. et al., 1995; Иллариошкин С.Н., 2002].

В результате прямой молекулярно-генетической диагностики у 57 из 59 больных хореей Гентингтона выявлена экспансия (CAG)n- повторов в 1 экзоне гена HD. Число (CAG)n-повторов на мутантных хромосомах у больных ХГ варьировало от 39 до 75, составляя в среднем 46.47±5.70.

С целью изучения характера генетической нестабильности (CAG)n повторов проведен анализ передачи их аллелей с экспансией в поколениях в 17 семьях больных ХГ, показавший, что величина мутации зависит от величины исходного аллеля в большей степени при передаче по материнской линии и в меньшей степени – по отцовской.

Установлено сцепление экспансии (CAG)n – повторов с полиморфным вариантом (CСG)7 и нейтральной делецией del2642. В результате определения гаплотипов (анализ по трем исследуемым локусам оказался возможным в 39 семьях больных ХГ) у больных ХГ из Башкортостана выявлено три основных гаплотипа, сцепленных с мутацией: (CCG)7/del– (48.72% семей), (CCG)7/del+ (46.15%) и (CCG)10/del– (5.13%), что позволяет предполагать, как минимум, три различных источника происхождения хореи Гентингтона в республике. Выявленное неравновесие по сцеплению экспансии (CAG)n повторов с (CCG)7, и ассоциация в популяциях Волго-Уральского региона аллелей (CAG)n>20 с аллелем (CCG)7 свидетельствуют не только о различных источниках заболевания, но и о том, что (ССG)n тракт может играть роль цис-активного фактора, модифицирующего стабильность (CAG)n повторов. Исходя из полученных данных, можно предположить, что новые случаи экспансии, возникающие из переходных аллелей, будут появляться на хромосомах, имеющих определенный гаплотип: (CCG)7/del- или (CCG)7/del+. Подтверждению этому может служить случайно обнаруженная мутация de novo - (CAG)36 в ходе популяционного анализа у индивида в возрасте 65 лет, не имевшего клинических признаков ХГ и с отрицательным семейным анамнезом по этому заболеванию. В данном случае экспансия была ассоциирована именно с гаплотипом (CCG)7/del-.

Проведен также анализ роли ряда генетических факторов на возраст появления первых признаков ХГ (табл.6). Установлено, что кроме величины экспансии CAG повторов (которая чем больше, тем раньше проявляется хорея), на возраст манифестации влияют также пол родителя – при передаче аллеля с экспансией от отца заболевание дебютирует, в среднем, на 4. 72 года раньше, чем при передаче от матери; наличие del2642 на хромосоме с экспансией (CAG)n, определяет более позднюю манифестацию ХГ. С возрастом появления первых клинических признаков заболевания ассоциированы и определенные генотипы локуса АроЕ: наличие генотипа 23 приводит к достоверному увеличению этого показателя. Вышеупомянутые факторы объясняют 88.71% возраста манифестации ХГ.

Таблица 6. Регрессионный анализ зависимости между возрастом манифестации ХГ и размером нормального аллеля, путем вертикальной передачи, наличием делеции del2642 и генотипом АроЕ с учетом размера экспансии (CAG)n повторов

Зависимые переменные (Х) Сводка регрессии
N R R2 p(X) B0 BX B(CAG)exp 1
(CAG)n О 2 31 0.8695 0.7560 0.8255 97.772 .1145 –1.339
М 3 17 0.8458 0.7154 0.7968 141.39 –.0785 –2.110
В целом 54 0.8228 0.6770 0.5140 110.888 0.1776 –1.599
Передача (CAG)exp 48 0.8700 0.7570 0.0086 125.402 –4.719 –1.479
del2642 46 0.8738 0.7635 0.0067 114.725 4.842 –1.661
ApoE 54 0.8335 0.6947 0.0542 110.009 1.521 –1.565


Pages:     | 1 |   ...   | 3 | 4 || 6 | 7 |   ...   | 8 |
 


Похожие работы:







 
2013 www.деньсилы.рф - «МЕДИЦИНА-ЛЕЧЕНИЕ-ОЗДОРОВЛЕНИЕ»

Материалы этого сайта размещены для ознакомления, все права принадлежат их авторам.
Если Вы не согласны с тем, что Ваш материал размещён на этом сайте, пожалуйста, напишите нам, мы в течении 1-2 рабочих дней удалим его.